一、《卡片式的港澳通行证》过关方法：
（1）第一次使用卡式通行证必须走人工通道，第二次开始则可以走自助通关
（2）自助通关的机子一共有两关
第一关：按照机子上的图标，把卡放在验证机上，上面会有中文提示，可以取卡后将卡移走，门自动打开
第二关：验证指纹，镜头识别面部，把拇指放上去验证即可如有特殊情况发生，会有工作人员帮助
二、《电子往来港澳通行证》过关方法：
（1）对于内地口岸，7 周岁以上（含）都可以使用自助通关，但下列情况除外从同时通航港澳的空港或海港口岸出境的，暂不可以使用自助通道持团队游签注的须团进团出也不能使用自助通关
（2）对于香港口岸，通行证持有人（包括重新申领）首次到香港的，须经人工通道通关。
持港澳前必须取得内地公安部门签发的来港澳目的签注如团体旅游、个人旅游、商务或其他签注等，港澳通行证俗称双程证，是中华人民共和国公安部出入境管理局签发给中国内地居民用于私人旅游、探亲、从事商务、培训、就业、留学等非公务活动的旅行证件。通行证分为个人旅游、团体旅游、探亲、商务、其他、停留等类别。