二者都属于t细胞。辅助性t细胞可以识别抗原产生细胞因子，在体验免疫和细胞免疫当中都可以发挥作用。细胞毒性t细胞接收到辅助性t细胞传来的信息。增值分化为新的毒性t细胞。并且与靶细胞接触使把细胞裂解死亡。所以细胞毒性t细胞只参与细胞免疫。
1、数量不同。辅助性T细胞数量比杀伤T细胞多，辅助性T细胞占T细胞总数的65％左右。
2、功能不一样。Th细胞能识别抗原，分泌多种淋巴因子，既能辅助B细胞活化，产生抗体增强体液免疫应答，又能辅助T细胞产生细胞免疫应答；从多方面引起和增强免疫能力。辅助t细胞具有协助体液免疫和细胞免疫的功能，
辅助T细胞不直接对抗原产生效应，但辅助其他的淋巴细胞实现对抗原的免疫学效应，如辅助B细胞产生抗体，即B细胞单独存在不能产生抗体，只有靠辅助T细胞的帮助才能产生抗体。
3、与抗体工作不一样。Tc杀伤靶细胞不依赖于抗体，并能产生淋巴毒素，通过LT介导杀伤靶细胞。杀伤性T细胞能直接杀伤带抗原的靶细胞，如移植细胞、肿瘤细胞、以及受微生物感染的细胞等。