如果您购买的商铺是商业辅助房，需要申请办证，您可以按照以下步骤来办理。
1.准备材料：需要准备的材料包括《房屋产权证》、购房合同、购房发票等相关证明文件，以及营业执照、税务登记证、组织机构代码证等企业证明文件。
2.提交申请：将准备好的相关材料携带到当地的房产管理部门或者工商行政部门进行申请。一般情况下，您需要填写一份《商业辅助房办证申请书》，并提交相关材料以备审核之用。
3.审核审批：根据当地的政策法规，房产管理部门或者工商行政部门会对您提交的申请材料进行审核审批，并最终给出是否批准的结果。如果审核通过，您需要缴纳相应的办证费用和税费，然后领取相应的证明文件。否则，您需要按照要求进行整改，重新提交申请。
需要注意的是，因为不同地区的政策和要求可能会有所不同，所以在具体操作前，最好先到当地的部门了解相关的政策和程序，以免出现因为不了解政策而影响到您的申请。
买商铺办的房产证不是小产权证。小产权房是农村集体土地上建造的房屋，不属于国家承认的合法房产，没有土地使用证和房产证，产权不被法律保护。商铺性质是商业用地，拥有土地使用权和房产证。房产证是国家对房屋产权归属的证明，具有法律效力，受法律保护。
需要具体情况具体分析。
商业辅助房指该房屋可以用于商业活动或者办公，但不可以用于居住。
如果购买的商铺是商业辅助房，则需要进行相关的规划和用途审批，以确保符合相关法律法规的要求。
另外，如果此前该商铺已经被使用为商业用途，但缺乏相应的证件和手续，则需要及时办理，并遵守相关规定。
需要注意的是，在购买商铺前，一定要了解清楚该商铺的使用用途和相关手续，以避免出现法律纠纷和经济损失。