乡镇医院收入的来源有五点，（一）人员经费，包括编内在职人员基本工资及绩效工资、离退休人员经费、社会保障经费、住房公积金等。

其中财政供给的人员经费在财务核算时列入“财政补助收入”。

（二）医疗收入，包括门诊收入和住院收入。

（三）财政补助收入，除按规定由财政供给的人员经费外，还包括基本建设、设备购置、公共卫生服务、人才培养等补助收入。

（四）上级补助收入，包括从主管部门和上级单位等取得的非财政性补助收入。

（五）其他收入，包括社会捐赠、利息收入、确实无法支付的应付款项、财产物资的盘盈等。