医疗保险断交有影响，会影响缴费年限。在医疗保险年度内累计中断参保超过3个月的，重新计算参保的连续年限。参加医疗保险的总年限是可以累积的，只是医疗年度内连续中断3个月以上的，需要重新开始计算可报销的连续年限。
1.断缴会影响医保待遇
医保中断期间不能享受医疗报销等医保待遇。
2.断缴影响缴费年限
中断缴费3个月以内的灵活就业人员，足额补缴欠缴的医保费后，视为连续缴费，欠缴期间发生的医疗费用予以补支。中断缴费3个月以上的灵活就业人员，视为初次参保，等待期(6个月)重新计算，自重新缴费之月起6个月后开始享受医保待遇。
3.一线城市政策与社保缴纳年限挂钩
在北京，外埠户籍需要连续上满一定年限的社保才能在北京买车摇号和买房(这里的社保只包括五险)。若期间内断缴，则会受到影响。
医疗保险断交3个月不会影响累计年限。医保的累计缴费年限不会因为中断缴费而清零，但医保的报销待遇将会直接停止。中断后继续缴费的，必须按规定以补缴时当地上年度职工平均工资为缴费基数，将中断期间的全部欠费补齐。补缴时间计入连续缴费时间，但补缴期间不能享受统筹基金支付的待遇。因此，虽然断交不会影响累计年限，但可能会造成其他不利影响，建议按时缴纳医疗保险费用。