事业单位和企业都需要为员工缴纳社会保险，包括养老保险、医疗保险、失业保险等。虽然两者都需要缴纳保险费，但并不算重复缴费。因为事业单位和企业是不同的组织形式，其缴纳的保险费用是分开计算和管理的。
员工在不同单位工作时，每个单位都会按照规定缴纳相应的保险费，这样可以确保员工在不同单位间享受到相应的社会保险待遇，避免了重复缴费的情况发生。
事业单位和企业单位的认定是由国家发改委、人社部、财政部、审计署等有关部门负责的。
一般来说，事业单位的认定需要考虑其性质、管理体制、经费来源等方面的因素；企业单位的认定则需要考虑其注册类型、股权性质、盈利目的等方面的因素。
具体认定程序和标准可以参考相关部门的规章制度和通知文件。