栖霞寺位于栖霞山中峰西侧，是南京境内最早的寺庙，是国家4A风景区。
鸡鸣寺的历史可追溯至东吴的栖玄寺，建造地为三国时属吴国后苑之地，西晋永康元年在此倚山造室，创建道场；东晋后这里被辟为廷尉署，梁武帝在鸡鸣埭兴建，从此这里便成为真正的佛教胜地。
所以鸡鸣寺是南京最古老的皇家寺庙！
南京最大的教堂是圣训堂，位于建邺区乐山路158号，主堂能容纳5000多个座位。圣训堂是南京基督教总会所在地，被评为河西新城十大精品建筑、南京新世纪十佳标志性建筑。此外，南京还有其他著名的教堂，如莫愁路堂和太平南路的圣保罗堂。